I dette hus mødtes den 20. januar 1942 femten højtrangerende repræsentanter for SS, NSDAP og forskellige ministerier, for at koordinere den planlagte deportation og drab på jøderne. Mødet, der idag er kendt som Wannsee-konferencen, blev ledet af Reinhard Heydrich, chef for Reichssicherheitshauptamt. Heydrichs deportationsekspert, Adolf Eichmann, udfærdigede protokollen, der blev fundet blandt udenrigsministeriets dokumenter i 1947. Protokollen dokumenterer med rystende tydelighed planen for drabet på de europæiske jøder, og det tyske forvaltningsapparats andel i dette folkemord.